Коли протягом пишеться разом?

Протягом (і) завжди пишеться окремо (прийменник: протягом року; прийменник + іменник: протягом річки), злите написання неможливе.

Якщо можна вставити слово між прийменником «в» і словом «течія», то перед нами іменник з приводом. Якщо таке неможливо, то в пропозиції прийменник «у течія», який пишеться у два слова і наприкінці з літерою «е». Іншого варіанта написання цього приводу немає.

У течія – прийменник (те саме, що 'під час, під час'), наприклад: в течія життя. У течії – поєднання прийменника і іменника течія, наприклад, в течії річки.

Тому правильно: "Приймати препарат на протязі 3 днів", т. до." течія– Прийменник.